V akademickom roku 2024/2025 otvára FCHPT nasledujúce doktorandské študijné programy:
- Analytická chémia
- Anorganická chémia
- Anorganické technológie a materiály
- Biochémia
- Biotechnológia
- Biotechnológie (double-degree)
- Fyzikálna chémia
- Chémia a chemické technológie (double-degree)
- Chémia a technológia požívatín
- Chémia a technológia životného prostredia
- Chemické inžinierstvo
- Organická chémia
- Riadenie procesov
- Technológia polymérnych materiálov
- Technológie spracovania a nástroje na spracovanie polymérnych materiálov
